FP6:
– The European network on emerging diseases and invasive species threats to Europen forest ecosystems (FORTHREATS) (2007-2009 m., dr. Vaidotas Lygis).
http://www.mykopat.slu.se/ShowPage.cfm?OrgenhetSida_ID=8724
– Co-ordination of Research on Genetic Resistance to Plant Pathogenic Viruses, and their Vectors, in European Crops (ResistVir) (2005-2009 m., habil. dr. Juozas Staniulis).
http://www.resistvir-db.org/

COST:
– Action 873: Bacterial diseases of stone fruits and nuts (2006–2011 m., dr. Banga Grigaliūnaitė, dr. Daiva Burokienė):
http://w3.cost.esf.org/index.php?id=181&action_number=873
– Action FP0601: Forest management and the water cycle (FORMAN) (2006–2011 m., dr. Jurga Motiejūnaitė)
http://w3.cost.esf.org/index.php?id=143&action_number=FP0601
– Action FP0701: Post-Fire Forest Management in Southern Europe (2008–2012 m., dr. Vaidotas Lygis)
http://w3.cost.esf.org/index.php?id=143&action_number=FP0701
– Action FA0602: Bioactive food components, mitochondrial function and health (MITOFOOD) (2007–2011 m., dr. Jolita Radušienė)
http://w3.cost.esf.org/index.php?id=181&action_number=FA0602; http://www.mitofood.eu/
– Action FA0807: Integrated Management of Phytoplasma Epidemics in Different Crop Systems (2009-2012 m., dr. Rasa Jomantienė, dr. Deividas Valiūnas)http://w3.cost.esf.org/index.php?id=181&action_number=FA0807
 -  COST ACTION FA0605. SIGNALLING CONTROL OF STRESS TOLERANCE AND PRODUCTION OF STRESS PROTECTIVE COMPOUNDS IN PLANTS (2007-2011, dr. Virgilija Gavelienė)  http://cost-inpas.org/
 - COST ACTION FA0603: Plant Proteomics in Europe EUPP (European Plant Proteomics) (2007-2011, Habil. dr., Nijolė Anisimovienė) http:/costfa0603.org

 - COST ACTION FA0906: A Specific Regulator of Plant Growth and Food Quality in a Changing Climate“ ( UV4 GROWTH ) (2010-2014, dr. Regina Vyšniauskienė, Dr. Vida Rančelienė) http://w3.cost.eu/index.php?id=181&action_number=FA0906

 Kiti tarptautiniai projektai:

– Enhanced control of Potato mop-top virus in the Nordic and Baltic Sea region (habil. dr. Juozas Staniulis).
– USDA-ARS Specific Cooperative Agreement 58-1275-6-F142 Genome based markers for detecting plant pathogenic phytoplasmas (Fitovirusų laboratorija).

LR Švietimo ir mokslo ministerijos inicijuotas tarptautinis projektas: Lietuvos–Ukrainos dvišalio bendradarbiavimo mokslinių tyrimų srityje programa

Dekoratyvinių augalų virusinių patogenų biologinės įvairovės monitoringas Ukrainoje ir Lietuvoje. Partneriai – GTC Botanikos institutas – mokslinio tyrimo vadovė dr. Marija Samuitienė – Kijevo Taraso Ševčenkos vardo nacionalinis universitetas – mokslinio tyrimo vadovas  prof. dr. Valeriy Polischuk. 2009–2010 m.

Runkelių rizomaniją sukeliančio viruso ir kitų dirvožemiu plintančių virusų izoliatų Lietuvoje ir Ukrainoje identifikavimas bei genomo lyginamoji molekulinė charakteristika. Partneriai – GTC Botanikos institutas – mokslinio tyrimo vadovas  habil dr. Juozas Staniulis – Ukrainos agrarinių mokslų akademijos Cukrinių runkelių institutas – mokslinio tyrimo vadovas  dr. Alisher Nurmukhammedov. 2009–2010 m.

Šiaurės Europos šalių inicijuoti mokslinių tyrimų projektai

Fraxinus excelsior nykimas Šiaurės Europoje. Rėmėjas: Šiaurės Europos bendradarbiavimo miškotyros srityje komitetas (SNS – SamNordisk Skogforskning). Projekto koordinatorius: Švedijos agrarinių mokslų universitetas (SLU). Atsakingi vykdytojai – dr. Vaidotas Lygis ir dr. Daiva Burokienė. Trukmė: 2010–2012 m.

Miškų regeneracija ir tvarumas miško/stepės riboje, siekiant valdyti dykumėjimo plitimą Ukrainoje. Rėmėjas: Švedijos Institutas (Svenska Institutet, Visby Program). Projekto koordinatorius: Švedijos agrarinių mokslų universitetas (SLU). Atsakingas vykdytojas – dr. Vaidotas Lygis. Trukmė 2009–2011 m.

Šiaurės šalių bendradarbiavimas miškų patologijos srityje kaip virtualus aukšto lygio tyrimų centras. Rėmėjas: Šiaurės Europos bendradarbiavimo miškotyros srityje komitetas (SNS – SamNordisk Skogforskning). Projekto koordinatorius. Suomijos miškų tyrimo institutas (METLA). Atsakingas vykdytojas – dr. Vaidotas Lygis. Trukmė  2007–2010 m.

Bendro Lietuvos ir Prancūzijos dvišalio bendradarbiavimo mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros srityje programa „Žiliberas“

Metalinių nanomedžiagų ekotoksikologinio poveikio gėlavandeniams dumbliams tyrimas. Partneriai – GTC Botanikos institutas – mokslinio tyrimo vadovas dr. Levonas Manusdžianas. - Université Paul Verlaine Metz – mokslinio tyrimo vadovas prof. dr. Jean-François Fèrard. Trukmė 2009–2010 m.

Baltijos šalių regiono programa 2007–2013 m.

Pavojingų medžiagų valdymas Baltijos jūros regione (COHIBA). Projekto koordinatorius - Ansa Pilke, Suomijos aplinkos institutas. Atsakingas vykdytojas – dr. Levonas Manusdžianas. 2009–2012 m.

Lietuvos mokslo tarybos projektai

Nacionalinės mokslo programos „Sveikas ir saugus maistas“ projektas

Retesniųjų uoginių augalų bioaktyvių komponentų kitimas priklausomai nuo genotipo ir aplinkos (UOGBIOGENA). Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Projekto vadovas – dr. Juozas Labokas. Trukmė: 2011–2014 m.

Nacionalinės mokslo programos „Lietuvos ekosistemos: klimato kaita ir žmogaus poveikis“ projektai

Invazinės rūšies sukelti biotinių ir abiotinių ekosistemos komponentų pokyčiai: kormoranų atvejis (KORMORANAI). Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo vadovė – dr. Jurga Motiejūnaitė. Trukmė: 2010–2011 m.

Ištirti vaismedžių ir daržovių svetimkraščių virusų genetinę įvairovę, plitimą lemiančius veiksnius. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo vadovas – habil. dr. Juozas Benediktas Staniulis. Trukmė: 2010–2011 m.

Neofitinės samanos Campylopus introflexus įtaka durpynų bendrijų formavimuisi. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo  vadovė – dr. Ilona Jukonienė. Trukmė: 2010–2011 m.

Oksidacinio streso hidrofitams kaita dėl acer negundo invazijos kintančių medžių lapų nuokritų. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo  vadovas – dr. Levonas Manusadžianas. Trukmė: 2010–2011 m.

Sėklomis plintančių svetimkraščių augalų rūšių invazyvumo vidiniai veiksniai. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo  vadovė – habil dr. Nijolė Anisimovienė. Vykdytojai Trukmė: 2010–2011 m.

Svetimkraščių Gonyostomum biologinis savitumas, genetinė įvairovė ir adaptacija naujose teritorijose. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo  vadovė – dr. Jūratė Kasperovičienė. Trukmė: 2010–2011 m. Lėšos – 565 900 Lt;

Žolinių svetimkraščių augalų rūšių genetinė įvairovė ir ją lemiantys veiksniai Lietuvoje. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Atsakingos vykdytojos – dr. Regina Vyšniauskienė, dr. Vida Rančelienė . Trukmė: 2010–2011 m.

Mokslininkų iniciatyva vykdomų mokslinių tyrimų projektai

Abiotinių veiksnių įtaka paprastojo kadagio α-pineno enantiomerų paplitimui. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo  vadovė –  dr. Kristina Ložienė. Trukmė: 2010–2011 m.

Jonažolių vaistinės žaliavos kokybės modeliavimas abiotinių ir biotinių veiksnių įtakoje. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo  vadovė – dr. Jolita Radušienė. Trukmė: 2010–2011 m.

Parazitinio grybo Chondrostereum purpureum panaudojimas lapuočių medžių atžėlimo kontrolei. Užsakovas Lietuvos mokslo taryba. Mokslinio tyrimo  vadovas – dr. Vaidotas Lygis. Trukmė: 2010–2011 m.

Kiti projektai

EB svarbos natūralių buveinių inventorizacijos metodinių dokumentų parengimas ir bandomoji natūralių buveinių inventorizacija. Užsakovas LR Aplinkos ministerija. Mokslinio tyrimo  vadovas – dr. Valerijus Rašomavičius. Trukmė 2009–2011 m.

23-ų saugomų ir retų rūšių apsaugos veiksmų planų parengimas.  Vadovas Floros ir geobotanikos laboratorija. Užsakovas LR Aplinkos ministerija. Atsakingas vykdytojas – dr. Zigmantas Gudžinskas. Trukmė 2009–2011 m.

7-ių invazinių rūšių populiacijų gausos reguliavimo veiksmų planų parengimas Trukmė 2009–2011 m. Užsakovas LR Aplinkos ministerija. Atsakingas vykdytojas –  dr. Zigmantas Gudžinskas. Trukmė 2009–2011 m.

Lietuvos valstybinio mokslo ir studijų fondo remiami projektai (http://www.vmsfondas.lt):

1) Aukštųjų technologijų plėtros programos projektai:

– Humanizuotų mielių raiškos sistemos kūrimas, panaudojant proteomikos ir genų inžinerijos metodus (Mielių humanizacija). Trukmė: 2008-2010 m. Vadovas – prof. Kęstutis Sasnauskas (BTI).
Partneris – Botanikos institutas (Fitovirusų laboratorija)

– Rinovirusų vaidmens alerginių ligų patogenezėje tyrimai ir diagnostika (RINOVIRUSAI IR ALERGIJA). Trukmė: 2008–2010 m. Vadovė – dr. Regina Ėmužytė (VU).
Partneris – Botanikos institutas (Fitovirusų laboratorija)

2) Pramoninės biotechnologijos plėtros programos projektai:

– Vaistinės augalinės žaliavos kokybės gerinimas naudojant augalų biotechnologijas (VAISTABIOTAS). Trukmė: 2007-2010 m. Vadovas – dr. J. Proscevičius (BI, Ląstelių inžinerijos laboratorija).

– Vaisiniai augalai – natūralių antocianinų producentai (ANTOCIANINAI). Trukmė: 2007-2010 m. Vadovas – dr. Tadeušas Šikšnianas (LSDI).
Partneris – Botanikos institutas (Augalų fiziologijos laboratorija, Ląstelių inžinerijos laboratorija)

– Aliejinių augalų produktyvumo ir atsparumo patogenams valdymas (Biokuras). Trukmė: 2008-2010 m. Vadovas – prof. habil. dr. Algirdas Sliesaravičius (LŽŪU).
Partneris – Botanikos institutas  (Augalų fiziologijos laboratorija, Ekonominės botanikos laboratorija)

– Viroidų ir fitoplazmų detekcija ir pašalinimas iš biotechnologinei pramonei vertingų augalų (FITOVIROIDAI). Trukmė: 2007–2009 m. Vadovas dr. Rokas Abraitis (BTI).
Partneris – Botanikos institutas (Fitovirusų laboratorija).

– Metagenominiai Lietuvos karštų požeminių vandenų ekstremofilų virusų tyrimai naujų fermentų paieškai
Trukmė: 2007–2009 m. Vadovė dr. Alma Gedvilaitė (BTI).
Partneris – Botanikos institutas (Fitovirusų laboratorija).

3) Prioritetinių Lietuvos mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros krypčių projektai:

– Ekosistemų vystymosi kryptys ir populiacijų filogeografijos molekuliniai tyrimai Baltijos regione. Trukmė 2007–2009. Vadovas habil. dr. Gediminas Valkiūnas (VU EI).
Partneris – Botanikos institutas (Mikologijos laboratorija).

– Biologinės invazijos Lietuvos ekosistemose klimato kaitos sąlygomis: priežastys, poveikis, prognozės (BINLIT). Trukmė 2008–2009 m. Vadovas prof. habil. dr. Sergej Olenin (KU).
Partneris – Botanikos institutas (Floros ir geobotanikos laboratorija, Mikologijos laboratorija)

– Prokariotai žemdirbystės efektyvumui ir saugių maisto produktų gamybos plėtrai (PROKTECHAS). Trukmė 2008-2010 m. Vadovė dr. Nomeda Kuisienė (VU).
Partneris – Botanikos institutas (Fitopatogeninių mikroorganizmų laboratorija, Hidrobotanikos laboratorija)

– Baltyminių nanofibrilių ir hibridinių darinių tyrimai (ProNanoFiHi). Trukmė 2007-2010 m. Vadovas dr. Arūnas Šetkus (Puslaidininkių fizikos institutas).
Partneris – Botanikos institutas (Genetikos laboratorija}